超低溫冷凍機組壓縮機故障之后，將原來損壞的超低溫冷凍機組壓縮機拆除后，這個時候需要對系統進行氮氣吹污處理，方可連接新的制冷壓縮機系統，接下來，在焊接作業時，為了不使銅管內壁生成氧化膜，建議通入氮氣，氮氣通往的時間要足夠。

　　更換壓縮機的時候，需要注意不要將更換壓縮機作為真空泵來排空外機管路中的空氣，否則會將燒毀壓縮機，所有使用真空泵來抽真空。還有將更換制冷壓縮機時加入符合壓縮機的適量的冷凍油。

　　壓縮機在換裝之前需要檢查造成原壓縮機損壞的原因，對不良部件進行更換，因為其它一些部件的故障也會直接導致壓縮機損壞。

　　在更換壓縮機的時候，還需要注意干燥器，一旦干燥器中的干燥劑已經飽和的話，就會失去濾水功能，影響使用。還需要把原先的制冷系統中的冷凍油換成新的冷凍油，因為新泵中已注入足量產冷凍滑油，不同牌號的冷凍油不能混用，否則會變質造成潤滑不良，導致制冷壓縮機拉缸，變黃，燒焦。

　　超低溫冷凍機組壓縮機更換還需注意防止系統中冷凍油過量，否則會導致系統的換熱效果降低，從而使系統壓力偏高，損壞系統和壓縮機。在加注制冷劑時不要太快，否則會產生液擊，致使閥片斷裂，造成壓縮機內響失壓。